Прозрачность. Прозрачность во всех трех водоемах увеличилась, так как произошли изменения ДОС (растворенный органический углерод).Показано (Watras, Baker, 1988), что низкие значения ДОС вызывают изменения в спектральном распределении света, укорачивая длину световой волны, что приводит к увеличению прозрачности.

Фитопланктон. Ацидификация не уменьшила продукцию фитопланктона, биомассу и хлорофилл в эпилимнионе, исключая осень, когда плотность клеток металимнических и гиполимнических видов переместилась в эпилимнион, продукция фитопланктона даже увеличилась в L 233 . Увеличение продукции в глубоких слоях произошло вследствии увеличения прозрачности. Вместе с тем, разнообразте видов фитопланктонного сообщества уменьшилось во всех трех озерах. Обнаружена значительная корреляция между рН и разнообразием.

Наблюдается снижение руководящей роли хризофит (Chrysophyllan), которые типичны для малых “мягких” озер. И увеличение динофлегеллят (dinoflagellates) и мелких цианофитов (Cyanophytes) Снижение разнообразия в фитопланктонном сообществе было главным образом вызвано уменьшившимся обилием нескольких первоначально доминирующих видов и увеличившимся обилием нескольких более толерантным к кислотности видам.Общее годовое число фитопланктонных видов значительно не изменилось: они колебались от 75 до 100.

Как указывает Шиндлер (Schindler et. al. 1991) в зоопланктоне трех озер, участвующих в эксперименте ,в процессе ацидификации наблюдались как сходные черты, так и несколько ключевых различий (Malley et.al. 1982; Frost Montz, 1988; Chang, Mailley, 1989; Gonzales et.al. 1990). Среди кладоцер Daphnia galeata mendotae доминировала первоначально в зоопланктоне озера 223, но она исчезла при рН 5,5 -–5,6. В LRL Daphnia dubia доминировала при естественном значении рН, а при снижении активной реакции среды ее численность уменьшилась. В обоих озерах Daphnia catawba заметно увеличила свою биомассу по мере уменьшения рН, но оставалась доминирующим видом при низких значениях рН. В LRL Daphnia parvula также увеличила численность при ацидификации не только после достижения величины рН 4,7. В озере 302S виды дафний D. retrocurva и D.longiremis полностью исчезли при рН 5,1. В последующем (1989 – 1990 гг.) D.catawba сначала появилась в небольших количествах, а затем численность ее заметно возрасла.

Среди коловраток Keratella taurocephala увеличивала биомассу в процессе ацидификации во всех трех озерах, участвующих в эксперименте. K cochlearis была доминирующим видом при высоких значениях рН и уменьшила свою численность по мере увеличения K. taurocephala. В озере Little Rock Lake (LRL) другие ранее обильные виды коловраток, включаяAsplanchna priodonta Kellicottia longispina ,Conochilus spp. Снизили свою численность, тогда как Synchaeta spp увеличилась при низких значениях рН. Наоборот, все представители рода Polyarthra выразили свою индиферентность к процессу ацидификации.

В первый , наиболее драматический период эксперимента по ацидификации в обоих озерах (223 и 302 S) отмечено исчезновение чувствительных к кислотности видов бентосных ракообразных. Сообщество бентосных ракообразных в озере LRL, где первоначальный состав отличался от озер в экспериментальной озерной области проявил меньшую восприимчивость к ацидификации. В озере 223 у Mysis relicta не наблюдалось воспроизводства при рН меньше 6 и они исчезли из водоема при рН 5,8 (Nero, Schindler, 1983).

Пресноводный рак Orconectes viridis в озере 223 уже при рН 5,6 начал снижать свою численность. Ряд изменений, как сопровождающих это снижение было зафиксировано, включая увеличение числа паразитов и сбрасывание икры (France 1987; France, Graham, 1985), уменьшение способности адсорбировать кальций при низких рН (Malley, 1980) и размягчение эксоскелета (Davies, 1989). Значительные негативные изменения происходили в процессах воспроизводства раков.

Популяция раков в озере 302S также сснизилась в процессе ацидификации, хотя здесь они не исчезли так быстро, как в озере 223:не наблюдалось увеличения паразита Thelophania.